DOKTOR ÖĞRETİM ÜYESİ FARUK ÇOLAK
Genel Bilgiler
Resim: |
|
İsim: |
FARUK ÇOLAK |
e-Posta: |
colak@beun.edu.tr |
Telefon: |
3722911793 |
Çalışma Alanları: |
Biyoloji Davranış Biyolojisi Hayvan Sistematiği None |
Öğrenim Bilgileri
BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİFEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / BİYOLOJİ |
08/09/2005 - Bitiş Tarihi 16/07/2008 |
BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİFEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ / BİYOLOJİ |
17/09/2001 - Bitiş Tarihi 10/02/2006 |
BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİFEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / BİYOLOJİ |
08/09/2008 - Bitiş Tarihi 05/05/2015 |
Yönetilen Tezler - Yüksek Lisans
Anadolu körfaresinin (Nannospalax xanthodon, 2n= 52 Sitotipi: RODENTIA) dağılım ve demografik özelliklerinin incelemesiBAHAR BAYRAMOĞLU |
Uluslararası Makaleler
Do Seismic Signals Diverge at the Level of Cytotypes in Turkish Blind Mole Rats?PAKISTAN JOURNAL OF ZOOLOGYTarih: 12/2020 Sayı: 6 Cilt: 52 Sayfa: 2101- ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT Endeks:SCI ISSN:0030-9923 doi:10.17582/journal.pjz/20190219110254 |
Genotypic similarities among the parthenogenetic Darevskia rock lizards with different hybrid originsBMC Evolutionary BiologyTarih: 9/2020 Sayı: 122 Cilt: 20 Sayfa: 1- Tarkhnishvili David,YANCHUKOV ALEXEY,ŞAHİN MEHMET KÜRŞAT,Gabelaia Mariam,Murtskhvaladze Marine,CANDAN KAMİL,Galoyan Eduard,Arakelyan Marine,Iankoshvili Giorgi,KUMLUTAŞ YUSUF,ILGAZ ÇETİN,MATUR FERHAT,ÇOLAK FARUK,Erdolu Meriç,Kurdadze Sofiko,Barateli Natia,Anderson Cort Endeks:SCI-Expanded ISSN:2730-7182 doi:10.1186/s12862-020-01690-9 |
First molecular detection and identification of Leishmania species in small wild rodents from TurkeyPARASITOLOGYTarih: 5/2020 Sayı: 10 Cilt: 147 Sayfa: 1088- KARAKUŞ MEHMET,ÖKTEM İBRAHİM MEHMET ALİ,SÖZEN MUSTAFA,MATUR FERHAT,ÇOLAK FARUK,Nalçacı Muhammed,ÖZBEL YUSUF,TÖZ SERAY Endeks:SCI-Expanded ISSN:0031-1820 doi:https://doi.org/10.1017/ S0031182020000803 |
Altitudinal Effects on Innate Immune Response of a Subterranean RodentZoological ScienceTarih: 2/2020 Sayı: 1 Cilt: 37 Sayfa: 31- MATUR FERHAT,SÖZEN MUSTAFA,ÇOLAK FARUK,YANCHUKOV ALEXEY,AYANOĞLU İHSAN CİHAN Endeks:SCI ISSN:0289-0003 |
Two major clades of blind mole rats (Nannospalax sp.) revealed by mtDNA and microsatellite genotyping in Western and Central TurkeyMammalian BiologyTarih: 1/2019 Sayı: 1 Cilt: 94 Sayfa: 38- MATUR FERHAT,YANCHUKOV ALEXEY,ÇOLAK FARUK,SÖZEN MUSTAFA Endeks:SCI ISSN:1616-5047 doi:10.1016/j.mambio.2018.11.004 |
Two new cytotypes and additional karyological records for blind mole rats Nannospalax xanthodon and N ehrenbergi Mammalia Rodentia in TurkeyFOLIA ZOOLOGICATarih: None/2015 Sayı: 2 Cilt: 64 Sayfa: 167- SÖZEN MUSTAFA,ÇOLAK FARUK,Sevindik Murat,MATUR FERHAT Endeks:SSCI ISSN:0139-7893 |
Cytotypes of Nannospalax xanthodon Satunin 1898 Rodentia Spalacidae from Western AnatoliaTURKISH JOURNAL OF ZOOLOGYTarih: 1/2013 Sayı: None Cilt: 37 Sayfa: 463- Sözen Mustafa, Çolak Faruk, Sevindik Murat, Matur Ferhat Atıf Sayısı: 9 Endeks:SSCI ISSN:13000179 doi:10.3906/zoo-1108-25 |
Chromosomal evolution of the Genus Nannospalax Palmer 1903 Rodentia Muridae from western TurkeyTURKISH JOURNAL OF ZOOLOGYTarih: 1/2013 Sayı: None Cilt: 37 Sayfa: 470- Matur Ferhat, Çolak Faruk, Ceylan Tuğçe, Sevindik Murat, Sözen Mustafa Atıf Sayısı: 9 Endeks:SSCI ISSN:13000179 doi:10.3906/zoo-1208-25 |
Karyological characteristics morphological peculiarities and a newdistribution locality for Talpa davidiana Mammalia Soricomorpha inTurkeyTURKISH JOURNAL OF ZOOLOGYTarih: None/2013 Sayı: 6 Cilt: 36 Sayfa: 806- Sozen Mustafa , Matur Ferhat , Colak Faruk , Irmak Sercan Atıf Sayısı: 1 Endeks:SSCI ISSN:None |
Phylogeny of species and cytotypes of mole rats Spalacidae in Turkeyinferred from mitochondrial cytochrome b gene sequenceesFOLIA ZOOLOGICATarih: 2/2012 Sayı: 1 Cilt: 61 Sayfa: 25- Kandemir Irfan , Sozen Mustafa , Matur Ferhat , Kankilic Teoman , Martinkova Natalia , Colak Faruk , Ozkurt Sakir O. , Colak Ercument Atıf Sayısı: 12 Endeks:SSCI ISSN:None |
Chromosome Differentiation of four 2n 50 Chromosomal Forms of Turkish Mole Rat Nannospalax nehringiZoological ScienceTarih: 1/2011 Sayı: 1 Cilt: 28 Sayfa: 61- Matur Ferhat, Çolak Faruk, Sevindik Murat, Sözen Mustafa Atıf Sayısı: 9 Endeks:SSCI ISSN:None |
Uluslararası Bildiriler (20)
Molecular phylogeny of Valentin Lizard, Darevskia valentini (Boettger, 1892) reveals new genetic lineages and may suggest taxonomic reconstruction(Özet bildiri) XX. European Congress of Herpetology 2019-09-02 2019-09-06 Sözlü Sunum CANDAN KAMİL,KORNILIOS PANAGIOTIS,YANCHUKOV ALEXEY,KUMLUTAŞ YUSUF,AYAZ DİNÇER,TARKHNISHVILI DAVID,MURTSKHVALADZE MARINE,KURDADZE SOFIKO,BARATELI NATIA,GABELAIA MARIAM,ŞAHİN MEHMET KÜRŞAT,MATUR FERHAT,GÜL SERKAN,YILDIRIM ELİF,ÇOLAK FARUK,ILGAZ ÇETİN Basım Tarihi : 06.09.2019 |
Microsatellite genotypes of seven hybridogenetic unisexual species of rock lizard and their putative bisexual parents (Genus: Darevskia sp.) suggest complex patterns of hybrid ancestry(Özet bildiri) XX. European Congress of Herpetology 2019-09-02 2019-09-06 Sözlü Sunum TARKHNISHVILI DAVID,YANCHUKOV ALEXEY,MURTSKHVALADZE MARINE,KURDADZE SOFIKO,BARATELI NATIA,GABELAIA MARIAM,ŞAHİN MEHMET KÜRŞAT,CANDAN KAMİL,KUMLUTAŞ YUSUF,ILGAZ ÇETİN,ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT,ERDOLU MERİÇ,ARAKELYAN MARINE,GALOYAN EDUARD Basım Tarihi : 06.09.2019 |
Structure Of Ancestral And Modern Populations In Bisexual And Parthenogenetic Lizards Of Genus Darevskia In East Anatolia And Caucasus(Özet bildiri) Ecology and Evolutionary Biology Symposium 2019-07-10 2019-07-12 Sözlü Sunum Erdolu Meriç,ŞAHİN MEHMET KÜRŞAT,Barateli Natia,Murtskhvaladze Marine,KUMLUTAŞ YUSUF,ILGAZ ÇETİN,ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT,CANDAN KAMİL,Tarkhnishvili David,YANCHUKOV ALEXEY Basım Tarihi : 12.07.2019 |
A phylogenetic study on Anatolian endemic Dryomys laniger (Mammalia: Rodentia) to determine an in-situ conservation area(Özet bildiri) 6th International Conference of Rodent Biology and Management and 16th Rodens et Spatium 2018-09-03 2018-09-07 Poster ÇETİNTAŞ Ortaç,SÖZEN MUSTAFA,IRMAK SERCAN,ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT Sayfa:265- ISBN:978-3-95547-059-3 Basım Tarihi : 03.09.2018 |
Partial coincidence of microsatellite genotypes suggests a possible role of backcrosses in diversification of parthenogenetic rock lizards(Özet bildiri) 5th Ecology and Evolutionary Biology Symposium 2018-07-18 2018-07-20 Sözlü Sunum Tarkhnishvili David,YANCHUKOV ALEXEY,ŞAHİN MEHMET KÜRŞAT,CANDAN KAMİL,ILGAZ ÇETİN,KUMLUTAŞ YUSUF,Kurdadze Sofiko,Barateli Natia,ÇOLAK FARUK,Murtskhvaladze Mari Basım Tarihi : 21.07.2018 |
First steps to resolve reticulate speciation process in bisexual and parthenogenetic lizards of genus Darevskia in East Anatolia and Caucacus(Özet bildiri) 5th Ecology and Evolutionary Biology Symposium 2018-07-18 2018-07-20 Poster ERDOLU MERİÇ,BARATELI NATIA,MAURTSKHVALADZE MARINE,ŞAHİN MEHMET KÜRŞAT,KUMLUTAŞ YUSUF,ILGAZ ÇETİN,MATUR FERHAT,CANDAN KAMİL,ÇOLAK FARUK,TARKNISHVILI DAVID,YANCHUKOV ALEXEY Basım Tarihi : 20.07.2018 |
Bartonella taylorii existence in Apodemus mice in Thrace Region of Turkey(Özet bildiri) 10th Balkan Congress of Microbiology, Microbiologia Balkanica ‘2017 2017-11-18 2017-11-20 Poster POLAT CEYLAN,ÇELEBİ BEKİR,KARATAŞ AHMET,IRMAK SERCAN,ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT,SÖZEN MUSTAFA,ÖKTEM İBRAHİM MEHMET ALİ Basım Tarihi : 20.11.2017 |
The first detection of Leishmaniasis in Turkish wild small rodents: Molecular detection of Leishmania infantum and Leishmania major in Turkish wild rodents.(Özet bildiri) 10th Balkan Congress of Microbiology, Microbiologia Balkanica ‘2017 2017-11-16 2017-11-18 Sözlü Sunum KARAKUŞ MEHMET,ÖKTEM İBRAHİM MEHMET ALİ,SÖZEN MUSTAFA,MATUR FERHAT,ÇOLAK FARUK,ÖZBEL YUSUF,TÖZ SERAY Basım Tarihi : 18.11.2017 |
The first detection of leishmaniasis in turkish wild small rodents: molecular detection of Leishmania infantum and Leishmania major in turkish wild rodents(Özet bildiri) 10th Balkan Congress of Microbiology 2017-11-16 2017-11-18 Sözlü Sunum KARAKUŞ MEHMET,ÖKTEM İBRAHİM MEHMET ALİ,SÖZEN MUSTAFA,ÇOLAK FARUK,ÖZBEL YUSUF,TÖZ SERAY Basım Tarihi : 18.11.2017 |
Bartonella Taylorii Existence In Apodemus Mice In Thrace Region Of Turkey(Özet bildiri) 10th Balkan Congress of Microbiology 2017-11-16 2017-11-18 Poster POLAT CEYLAN,ÇELEBİ BEKİR,KARATAŞ AHMET,IRMAK SERCAN,ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT,SÖZEN MUSTAFA,ÖKTEM İBRAHİM MEHMET ALİ Basım Tarihi : 18.11.2017 |
Molecular detection of Leishmania infantum and Leishmania major in Turkish wild rodents(Özet bildiri) 6th World Congress on Leishmaniasis 2017-05-16 2017-05-20 Poster KARAKUŞ MEHMET,ÖKTEM İBRAHİM MEHMET ALİ,SÖZEN MUSTAFA,MATUR FERHAT,ÇOLAK FARUK,ÖZBEL YUSUF,TÖZ SERAY Basım Tarihi : 20.05.2017 |
Investigation of seismic communication characteristics of Turkish nannospalax Mammalia Rodentia(Özet bildiri) Graduate Meeting 2015 Studying Animal Behaviour in the Field 2015-09-17 2015-09-19 Sözlü Sunum ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT Basım Tarihi : 19.09.2015 |
Altitudinal effects on innate immune response of Turkish blind mole-rats(Özet bildiri) 6. Ecology and Evolutionary Biology Symposium 2019-07-07 2019-07-12 Poster Solak Halil Mert,YANCHUKOV ALEXEY,ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT,SÖZEN MUSTAFA,Ayanoğlu IC,Winternitz Jamie |
Altitudinal effects on evolution of globin gene clusters and host adaptation on Nannospalax xanthodon(Özet bildiri) 5th Ecology and Evolutionary Biology Symposium 2018-07-18 2018-07-20 Poster Solak Halil Mert,YANCHUKOV ALEXEY,Winternitz Jamie,ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT |
artial coincidence of microsatellite genotypes suggests a possible role of backcrosses in diversification of parthenogenetic rock lizards(Özet bildiri) 5th Ecology and Evolutionary Biology Symposium 2018-06-18 2018-06-20 Sözlü Sunum TARKNISHVILI DAVID,YANCHUKOV ALEXEY,ŞAHİN MEHMET KÜRŞAT,CANDAN KAMİL,ILGAZ ÇETİN,KUMLUTAŞ YUSUF,KURDADZEL SABINA,BARATELI NATIA,MAURTSKHVALADZE MARINE,ÇOLAK FARUK |
Structure of Ancestral and Modern Populations in Bisexual and Parthenogenetic Lizards of Genus Darevskia in East Anatolia and Caucasus(Özet bildiri) Ecology and Evolution Biology Symposium 2019-06-10 2019-06-12 Poster ERDOLU MERİÇ,ŞAHİN MEHMET KÜRŞAT,BARATELI NATIA,MAURTSKHVALADZE MARINE,KUMLUTAŞ YUSUF,ILGAZ ÇETİN,ÇOLAK FARUK,MATUR FERHAT,CANDAN KAMİL,TARKNISHVILI DAVID,YANCHUKOV ALEXEY |
THE FIRST DETECTION OF LEISHMANIASIS IN TURKISH WILD SMALL RODENTS: MOLECULAR DETECTION OF LEISHMANIA INFANTUM AND LEISHMANIA MAJOR IN TURKISH WILD RODENTS(Özet bildiri) 10th Balkan Congress of Microbiology 2017-11-16 2017-11-18 Sözlü Sunum KARAKUŞ MEHMET,ÖKTEM İBRAHİM MEHMET ALİ,SÖZEN MUSTAFA,MATUR FERHAT,ÇOLAK FARUK,ÖZBEL YUSUF,TÖZ SERAY |
Chromosomal evolution of Blind mole rat(Özet bildiri) 12th Rodens et Spatium 2010-07-19 2010-07-23 Sözlü Sunum MATUR FERHAT,ÇOLAK FARUK,SÖZEN MUSTAFA |
Cytogenetic comparision of three 2n= 50 cytotypes of Nannospalax nehringi (Mammalia: Rodentia) from Turkey(Özet bildiri) 11th Rodens et Spatium 2008-06-18 2008-06-22 Sözlü Sunum MATUR FERHAT,SÖZEN MUSTAFA,ÇOLAK FARUK |
Comparation baculum morpholgy of four chromosomal forms (2n= 38, 2n= 52, 2n= 56 and 60) of Nannospalax nehringi (Mammalia: Rodentia) in Turkey(Özet bildiri) 11th Rodens et Spatium 2008-06-18 2008-06-22 Sözlü Sunum MATUR FERHAT,SÖZEN MUSTAFA,ÇOLAK FARUK |
Ulusal Bildiriler
Kırklareli bölgesindeki kemiricilerde Flebovirüs, Flavivirüs ve Alfavirüs etkenlerinin varlığının ve dağılımının araştırılması(Özet bildiri)5. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi 2019-10-28 2019-11-01 Poster DEMİRAY GÜRBÜZ EBRU,ERGÜNAY KORAY,POLAT CEYLAN,IRMAK SERCAN,KARATAŞ AHMET,SÖZEN MUSTAFA,MATUR FERHAT,ÇOLAK FARUK,ÖZBEK ÖZGEN ALPAY,ÖKTEM İBRAHİM MEHMET ALİ Basım Tarihi : 28.10.2019 |
Projeler
Körfarelerin Dağılım ve Demografik Özelliklerinin Mikrosatellit Markörler Kullanılarak İncelenmesi(Körfare Populasyon Biyolojisi, Demografisi, Populasyon Sütrüktürü Hakkında Bilgi tplamak)Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi 14 (Devam Ediyor) 2019-06-15 |
Doğu Anadolu Ve Kafkaslardaki Biseksuel Ve Partenogenetik Darevskia Genusundaki Kertenkelelerin Ağsı Türleşme Sürecinin Çözümlenmesi(Doğu Anadolu ve Gürcistan’daki kaya kertenkeleleri, Darevskia çift eşeyli ve partenogenetik tek eşeyli türlerin bir arada bulunduğu nadir bir biyolojik sistemi temsil eder. Partenogenetik kertenkele türlerinin her biri birkaç yüz bin yıl önce, iki farklı çift eşeyli türün hibritleşmesi sonucu oluşmuştur. Şu ana kadar yalnızca dört atasal çift eşeyli türden meydana gelen yedi tek eşeyli tür tespit edilmiştir. Bunun nedeni aynı atasal çiftin genellikle her biri farklı morfolojiye ve ekolojik tercihlere sahip birkaç farklı tek eşeyli tür meydana getirmesidir. Hibritleşme ve adaptasyon süreci birkaç kardeş tek eşeyli popülasyonda parallel gerçekleştiği içinDarevskia cinsi reticulate partenogenetik evrimin ve adaptasyonun genetik mekanizmalarını anlamamızı sağlayacak eşsiz bir örnek niteliğindedir. Darevskia cinsi partenogenezin 50 yıldan uzun bir süre önce keşfedildiği ilk karasal omurgalı grubudur. O zamandan beri popülasyon yapısıyla ilgili çeşitli çalışmalar yürütülmüş, yeni partenogenetik formlar tanımlanmış ve bunların çift eşeyli atasal türleri belirlenmiştir. Allozim ve mtDNA markerların kullanıldığı çalışmalarda tek eşeyli türler içinde gözlemlenen yüksek düzeydeki genotipik çeşitlilik, harici partenogenezin genotip çeşitliliğinde düşüşe yol açacağına yönelik teorik tahminlerle bariz bir karşıtlık göstermektedir. Bu karşıtlık (i) sınırlı etki rekombinasyonuyla klon soylardaki rasgele mutasyonların birikmesiyle (ii), günümüzdeki tek eşeyli türleri meydana getirmiş olan geçmişteki hibtitleşmelerle (iii) ve atasal (baba soylu) bir çift eşeyli türden onun kardeş partenogenetik formuna çapraz gen akışıyla açıklanabilir. Bu projede Darevskia’nın tek eşeyli türlerinde genetik varyasyonların sürdürülmesinde bu üç senaryonun göreceli rolünü çözmeyi amaçlıyoruz. Altı partenogenetik ve dört atasal çift eşeyli türün popülasyonunun genetik yapısını ilk kez inceleyeceğiz. Öncelikle beş mikrosatellit marker kullanarak müze örnekleri üzerinde öncü bir genotipik tarama yapacağız. Daha sonra türlerin tamamını temsil eden 285 adet örnek üzerinde binlerce yüksek çözünürlüklü genomik ddRAD markerında geniş çaplı bi genotipleme yapacağız ve biyoinformatik analizlerle her bir genotipi belirleyeceğiz. Genetik çeşitliliğin kökenini bulmak için uygun popülasyon genetiği modellemesi kullanılarak üç hipotezin (I-iii) simülasyonu yapılacak ve her bir senaryoun her bir tek eşeyli tür için göreceli önemini anlayabilmek için sonuçlar gözlemlenen verilere karşı test edilecek. İki ülke de Darevskia’da ağsı evrimin neredeyse eksiksiz bir tablosunu sergilediği için hedefimizin gerçekleşebilmesi, ancak Türkiye ve Gürcistan arasındaki bilimsel işbirliğiyle mümkündür. Üstelik her iki ülkedeki araştırma grupları da Darevskia kertenkeleleriyle uzun süredir ilgilenmektedir ve projenin gerçekleşebilmesi için gerekli olan uzmanlığa, laboratuar olanaklarına ve araç-gerece sahiptir. Proje süresince biri Türkiye’den diğeri Gürcistan’dan iki doktora öğrencisi eğitim görecek ve araştırmanın bütün basamaklarına katılacaktır. İkili işbirliğiyle gerçekleştirilecek olmasının yanı sıra, projenin sonuçları her iki ülkede bulunan üniversitelerdeki akademik araştırma topluluklarına büyük yarar sağlayacaktır. Etki değeri 4’ten büyük bir dergide en az iki ve etki değeri 2’den büyük başka bir dergide en az iki, ortak yazarlı makale çıkarmayı hedefliyoruz.)Uluslararası İkili İşbirliği Programları 28 (Tamamlandı) 2018-03-01 - 2020-03-01 |
Türkiye Körfarelerinin (Nannospalax Sp.) Hipoksiyadan Sorumlu Genlerdeki Yükseklik Varyasyonları(Birçok memelinin düşük oksijen konsantrasyonunda aktif metabolizmasını korumasını sağlayan kayda değer özelliği yüksek irtifalardaki ulaşılamayan birçok habitatı kullanmasına izin verir. Kaydedilmiş birçok durumda, bu adaptasyon moleküler oksijen taşımanın oldukça çok yönlü sisteminden dolayı mümkündür. Memeli hemoglobinleri, α- ve β- globin gen kümesinde yerleşmiş globin gen ailesindeki bir kaç genin ortak ürünüdür. Bu genlerdeki basit bir mutasyon sıklıkla O2 bağlama fonksiyonlarında önemli gelişmelere neden olur, bu da populasyonun yüksek çevrelerde hızlıca adaptasyonunu ve kolonizasyonunu sağlar. Bu gibi basit mutasyonal transisyonlar, gerçekleşmesi içi uzun süreler gereken anatomik seviyedeki mutasyonlar gibi daha kompleks evrimsel adaptasyonlara tercih edilir. Bu hipoteze göre, ana DNA dizisindeki yükseklikle ilgili farklılıklar yakın zamanlarda ayrılmış ya da insanlar da dâhil aynı tür içerisinde daha sık gözlemlenir [1-4].Nannospalax cinsinden kör fareler kapalı toprak altı tünellerde yaşamak için çoklu adaptasyonlara sahiptir. Birçok zorluk içerisinde, toprakaltı yaşam tarzından dolayı olan hipoksik stresle (çevresel O2 düzeyindeki düşüş) baş etmek zorundadırlar. Bu sert faktöre ek olarak Spalacidae’nin bazı türleri özellikle Nannospalax xanthodon deniz seviyesinden 3000 m’ye kadar yayılmaktadır. Bu yükseklikte, toprakaltının ve yüksek irtifa hipoksiyasının etkileri, teorik olarak çevresel oksijen konsantrasyonu bileşimi minimum 4,9 olacaktır. Tek bir türde bu kadar geniş bir yükseklik aralığındaki dağılım moleküler seviyede olasılıkla adaptasyon mekanizmasında mutasyonlar yapacaktır. Bu hipotezi test etmek için, 1000-3000 mt arasında bulunan N. xanthodon’un farklı doğal populasyonlarının örneklerindeki α- ve β- globin genlerindeki DNA dizi polimorfiziminiaraştırmayı planlamaktayız. Allopatrik çeşitlenme, üreme izolasyonu ve habitat farklılığı gibi populasyon yapısını etkileyen diğer faktörlerin etkisini en aza indirmek için Niğde, Mersin ve Konya illeri arasında kalan 90 km yarıçaplı bir alanda tek bir sitotipe (2n= 58) odaklanacağız. Verimizdeki yükseklik etkisini nötral çeşitlenmeden daha fazla ayırmak için globin genlerindeki varyasyon ile bir mtDNA ve 4-5 nüklear DNA marker lokusu ile karşılaştıracağız. Hayvanları araziden toplayıp, her iki gen bölgesinin uzun parçalarını amplifiye etmek için uzun aralıklı PCR kullanacağız. Ampfliye edilmiş ve izole edilmiş parçalar, dizileme yapılacak ve globin gen kümeleri de novo veya son zamanlarda yayınlanan körfarelerin (tesadüfen alçak irtifalarda bulunan) farklı türlerinin tüm genomları referans olarak kullanılarak birleştirilecek. İlave olarak, Türkiye’xxde yaşayan diğer iki körfare türü olan N. ehrenbergi ve N. leucodon’xxdan da 2’xxer bireyin dizileri elde edilecek körfare türlerinin filogenetk ilişkileri globin geni düzeyinde yorumlanacaktır. Bu araştırma, gerçek toprak altı memelileri için yükseklikle bağlantılı genetik polimorfizm hakkında ilk çalışma olacaktır. Elde edilecek veri, N. xanthodon globin gen yapısını diğer kemirici türleri için elde edilmiş verilerle karşılaştırmak, fonksiyonel gen seviyesindeki evrimsel çeşitlenmeyi açığa çıkarmak için kullanılacaktır. Etki değeri 3’ün üzerinde dergilerde en azından iki yayın, önerilen projeden beklenmektedir, ayrıca sekans polimorfizmine ek olarak körfare hemoglobinin fonksiyonel özelliklerinin araştırılması konulu bir devam projesi planlanmaktadır.)-Tübitak 3001 25 (Tamamlandı) 2018-02-01 - 2020-10-01 |
Üniversite Dışı Deneyimler
zonguldak karaelmas üniversitesi2008-0 Arş. grv
|