KADİR DEMİR

MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ / FİZİK MÜHENDİSLİĞİ

FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / FİZİK

FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / FİZİK

FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / FİZİK

FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / FİZİK

Tetramerik hexcoil-ala demetinin moleküler dinamik simülasyon yöntemi ile incelenmesi

HAKAN ALICI
Bülent Ecevit Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fizik Ana Bilim Dalı

Bazı peptid ligandlarının moleküler dinamik simülasyon yöntemi ile incelenmesi.

NESRİN KILIÇ
Bülent Ecevit Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fizik Ana Bilim Dalı

Möleküler dinamik simülasyon yöntemiyle peptidlerin farklı çözücüler içindeki yapılarının incelenmesi.

YILDIZ BERK
Bülent Ecevit Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Fizik Ana Bilim Dalı

Design and various in silico studies of the novel curcumin derivatives as potential candidates against COVID-19 -associated main enzymes

Computational Biology and Chemistry

Tarih: 6/2022 Sayı: None Cilt: 98 Sayfa: 107657- ALICI HAKAN, TAHTACI HAKAN, DEMİR KADİR

Endeks:SCI ISSN:1476-9271 doi:10.1016/j.compbiolchem.2022.107657

Website

Parkinson Hastalığı ile İlişkilendirilen PreNAC Fibril Kesiti ve Onun A53C, A53E, A53G, A53T, A53V Mutasyonlarının Yapısal Kararlılığın Araştırılması

Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi

Tarih: 5/2021 Sayı: 1 Cilt: 16 Sayfa: 66- ALICI HAKAN, DEMİR KADİR

Endeks:TR DİZİN ISSN:1306-7575 doi:10.29233/sdufeffd.824140

Website

Investigation of the stability and the helix-tail interaction of sCT and its various charged mutants based on comparative molecular dynamics simulations

CHEMICAL PHYSICS

Tarih: 1/2021 Sayı: None Cilt: 542 Sayfa: 111057- ALICI HAKAN, DEMİR KADİR

Endeks:SCI ISSN:0301-0104 doi:https://doi.org/10.1016/j.chemphys.2020.111057

Website

First principles study on new half-metallic ferromagnetic ternary zinc-based sulfide and telluride (Zn3VS4 and Zn3VTe4)

Materials Research Express

Tarih: 4/2019 Sayı: 7 Cilt: 6 Sayfa: 76107- ERKİŞİ AYTAÇ,YILDIZ BUĞRA,DEMİR KADİR,SÜRÜCÜ GÖKHAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:2053-1591 doi:https://doi.org/10.1088/2053-1591/ab13e0

Website

İnsan Kemokin Reseptörü CXCR3'ün N-Terminal Bölgesinin (1-53) Moleküler Dinamik Simülasyon Yöntemi İle Modellenmesi ve Yapısal Analizi

Karaelmas Science and Engineering Journal

Tarih: 12/2018 Sayı: 2 Cilt: 8 Sayfa: 606- ALICI HAKAN,KARACAOĞLAN VOLKAN,DEMİR KADİR

Endeks:TR DİZİN ISSN:2146-7277","2146-4987

Website

Conformational stability of the tetrameric de novo designed hexcoil-Ala helical bundle

Chinese Journal of Physics

Tarih: 2/2018 Sayı: 1 Cilt: 56 Sayfa: 46- DEMİR KADİR,ALICI HAKAN,YAŞAR FATİH

Endeks:SCI-Expanded ISSN:05779073 doi:10.1016/j.cjph.2017.12.004

Website

The investigation of the secondary structure propensities and free energy landscapes of peptide ligands by replica exchange molecular dynamics simulations

Molecular Simulation

Tarih: 1/2014 Sayı: 13 Cilt: 40 Sayfa: 1015- Demir Kadir, Kılıç Nesrin, Dudak Fahriye Ceyda, Boyacı İsmail Hakkı, Yaşar Fatih

Endeks:SCI ISSN:0892-7022 doi:10.1080/08927022.2013.835486

Website

Enhancing The Affinity of SEB Binding Peptides By Repeating Their Sequence

BIOPOLYMERS

Tarih: 12/2012 Sayı: 98 Cilt: 2 Sayfa: 145- Dudak FC, Kılıç N, Demir K, Yaşar F,Boyacı IF

Endeks:SCI ISSN:0006-3525 doi:10.1002/bip.22012

Website

Solvation model effects on two specific peptides of milk protein

CHINESE JOURNAL OF PHYSICS

Tarih: 12/2007 Sayı: 6 Cilt: 45 Sayfa: 622- Yasar Fatih , Demir Kadir

Endeks:SCI ISSN:0577-9073

Website

The study of helix coil transition of polyalanine with single histogram method

Computer Physics Communications

Tarih: 11/2006 Sayı: 9 Cilt: 175 Sayfa: 604- Yaşar F., Demir K.

Endeks:SCI ISSN:00104655 doi:10.1016/j.cpc.2006.07.008

Website

STUDY OF TWO BIOACTIVE PEPTIDES IN VACUUM AND SOLVENT BY MOLECULAR MODELING

International Journal of Modern Physics C

Tarih: 6/2006 Sayı: 06 Cilt: 17 Sayfa: 825- YAŞAR F., DEMIR K.

Endeks:SCI ISSN:0129-1831 doi:10.1142/S0129183106009382

Website

Analysis of Poly ethylene oxide Lithium Sodium Dodecyl Sulfate Interactions by Electron Paramagnetic Resonance Simulation of 16 Doxyl StearicAcid

Applied Magnetic Resonance

Tarih: 12/2005 Sayı: 29 Cilt: 4 Sayfa: 627- Kadir Demir, Dilek Dadayli Paktaş

Endeks:SCI ISSN:1613-7507 doi:10.1007/BF03166339

Website

Influence of an external magnetic field on the current voltage characteristics and transport critical current density

Physica C: Superconductivity

Tarih: 1/1998 Sayı: 3-4 Cilt: 294 Sayfa: 203- Kiliç A, Kiliç K, Senoussi S, Demir K

Endeks:SCI ISSN:09214534 doi:10.1016/S0921-4534(97)01687-0

Website

The Study of REMD Simulation of SEB-Binding Repetitive Peptide Sequnces

Karaelmas Fen ve Mühendislik Dergisi

Tarih: 6/2017 Sayı: 1 Cilt: 7 Sayfa: 206- KILIÇ NESRİN,DEMİR KADİR

Endeks:TR DİZİN ISSN:2146-4987 doi:10.7212/zkufbd.v1i1.531

A MD study regarding conformational properties and structure-activity relationship of sCT and its variouscharged mutants

(Özet bildiri)

2nd International Eurasian Conference onBiological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2019) 2019-06-28 2019-06-29 Sözlü Sunum ALICI HAKAN,DEMİR KADİR Sayfa:396- Basım Tarihi : 30.06.2019

Computer Aided Prediction of Cxcr3 Binding Site

(Özet bildiri)

2nd International Congress on Advances in Bioscience and Biotechnology (ICABB) 2018-06-26 2018-06-30 Sözlü Sunum KARACAOĞLAN VOLKAN,ALICI HAKAN,DEMİR KADİR,CEYHAN DENİZ Basım Tarihi : 27.09.2018

Website

Structural Analysis of N-Terminal Region (1-53) Of Human Chemokine Receptor CXCR3 By Computational Studies

(Özet bildiri)

SECOND MEDITERRANEAN NATURAL SCIENCES AND ENGINEERING CONGRESS (MENSEC 2018) 2018-06-26 2019-06-29 Sözlü Sunum ALICI HAKAN,KARACAOĞLAN VOLKAN,DEMİR KADİR Sayı: 1 Cilt: 2 Sayfa:25- Basım Tarihi : 21.06.2018

An EPR Study of Polymer Surfactant SystemsUsing 16 Doxyl Stearic Acid

(Tam metin bildiri)

EPR-60 Modern Development of MagneticResonance 2004-08-15 2004-08-20 Davetli Konuşmacı DEMİR KADİR,Dadaylı Paktaş Dilek

Investigation Of The Conformational Stability Of Designed Homo Tetrameric Structure

(Özet bildiri)

From Computational Biophysics to Systems Biology 2016 (CBSB2016) 2016-05-23 2016-05-25 Poster ALICI HAKAN,DEMİR KADİR,YAŞAR FATİH

Stability Of The Self-Assembly Of Computer-Aided Design Structure

(Özet bildiri)

From Computational Biophysics to Systems Biology 2015 (CBSB2015) 2015-05-17 2015-05-19 Poster DEMİR KADİR,ALICI HAKAN,YAŞAR FATİH

The Investigation Of Peptide Abeta(11-40) By Replica-Exchange-With Tunneling Method

(Özet bildiri)

From Computational Biophysics to Systems Biology 2016 (CBSB2016) 2016-05-23 2016-05-25 Poster KILIÇ NESRİN,DEMİR KADİR,YAŞAR FATİH

Birbirini Tekrarlayan Peptid Dizilimlerinin İkincil Yapılara Etkisinin Moleküler Dinamik Simülasyon Yöntemiyle İncelenmesi

(Poster)

TFD28 International Physics Congress 2011-09-09 Demir K, Kılıç N, Yaşar F

Bazı Biyomoleküllerin Sebest Enerji Yüzeylerinin Temel Bileşen Analizi Principal Component Analysis PCA ile İncelenmesi

(Özet bildiri)

TFD28 International Physics Congress 2011-09-09 Kılıç N, Demir K, Yaşar F

Sodyum ve Lityum Dodesil Sülfatları ile Polietilen ve Polivinilalkol Arasındaki Etkileşmelerin DTBN Spin ProbKullanılarak EPR ile İncelenmesi

(Özet bildiri)

TFD-23 International Physics Congress 2005-09-16 Demir K, Paktaş DD, Sünnetçioğlu MM

Süperiletkenlerde Periyodik Akı Tutma Potansiyelinin Vortex hareketine Etkisi

(Özet bildiri)

2.Spil Fen Bilimleri Kongresi, Manisa 1997-11-02 Irmak AE, Kılıç A, Kılıç K, Demir K

Seramik süperiletkenlerde dış manyetik alan etkisi altında akım gerilim karakteristiklerinin incelenmesi

(Tam metin bildiri)

II.Spil Fen Bilimleri Kongresi 1997-10-27 Demir K, Kılıç A, Kılıç K, Irmak AE Sayi: 2 Cilt: 1 Sayfa:17-

Seramik Süperiletkenlerde Dış Manyetik Alan Etkisi Altında Akım Gerilim Karakteristiklerinin İncelenmesi

(Özet bildiri)

, 2.Spil Fen Bilimleri Kongresi 1997-10-23 1997-10-25 Demir K, Kılıç A, Kılıç K, Irmak AE

Seramik Süperiletkenlerde Akım Gerilim Karakteristiklerinin Dış Manyetik Alan Etkisi Altında İncelenmesi

(Özet bildiri)

TFD-17 Fizik Kongresi 1998-10-27 1998-10-31 Demir K, Kılıç A, Kılıç K

Polimer Yüzey Aktif çözeltilerinin EPR Spin Prob Tekniğiyle İncelenmesi

(Tam metin bildiri)

Türk Fizik Derneği 22. Fizik Kongresi 2004-09-17 Demir K, Paktaş DD, Sünnetçioğlu MM Sayi: 1 Cilt: 1 Sayfa:1-

Süperiletkenlerde periyodik akı tutma potansiyelinin vortex hareketine etkisi

(Tam metin bildiri)

II. Spil Fen Bilimleri Kongresi 1997-10-25 Irmak AE, Kılıç A, Kılıç K, Demir K Sayi: 2 Cilt: 1 Sayfa:10-

Polimer Yüzey Aktif çözeltilerinin EPR Spin Prob Tekniğiyle İncelenmesi

(Özet bildiri)

TFD-22 Fizik Kongresi 2004-09-14 2004-09-17 Demir K, Paktaş DD, Sünnetçioğlu MM

FEN FAKÜLTESİ

ATOM VE MOLEKÜL FİZİĞİ

FEN FAKÜLTESİ

ATOM VE MOLEKÜL FİZİĞİ

FEN FAKÜLTESİ

FEN FAKÜLTESİ

ATOM VE MOLEKÜL FİZİĞİ

SÜREKLİ EĞİTİM MERKEZİ

ATOM VE MOLEKÜL FİZİĞİ

SÜREKLİ EĞİTİM MERKEZİ

ATOM VE MOLEKÜL FİZİĞİ

SÜREKLİ EĞİTİM MERKEZİ

ATOM VE MOLEKÜL FİZİĞİ

FİZİK BÖLÜMÜ

FİZİK BÖLÜMÜ

EPR Spin Prob Yöntemiyle Çeşitli Katkılar İçeren Polimer Sistemlerin Yapısal ve Dinamik Özelliklerinin İncelenmesi

Proje Türü : (Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi)

Proje Durumu : (Tamamlandı)

Başlangıç Tarihi : 1999-07-01

Bitiş Tarihi : 2002-07-01

ZKÜ Bilimsel Araştırma Projesi 2009 13 03 03

Proje Türü : (BAP)

Proje Durumu : (Tamamlandı)

TÜBİTAK projesi TBAG 1546

Proje Türü : (TÜBİTAK PROJESİ)

Proje Durumu : (Tamamlandı)

ZKÜ Araştırma Fonu Projesi 99 12 03 11

Proje Türü : (BAP)

Proje Durumu : (Tamamlandı)

TÜBİTAK projesi TBAG 1876 199T107

Proje Türü : (TÜBİTAK PROJESİ)

Proje Durumu : (Tamamlandı)

TAEK ANAEM Projesi

Proje Türü : (ARAŞTIRMA PROJESİ)

Proje Durumu : (Tamamlandı)

BEÜ Bilimsel Araştırma Projesi 2015-22794455-03

Proje Türü : (Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi)

Proje Durumu : (Tamamlandı)

Başlangıç Tarihi : 2015-04-08

Bitiş Tarihi : 2017-11-24