İsim:
HAKAN ALICI
e-Posta:
hakanalici 
Telefon:
3722912361
Fax:
Yök Akademik Sayfa:
Çalışma Alanları:
Fizik
Atom, Molekül ve Lazer Fiziği
Biyofizik
Doktora
2012-2018BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİ
FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / FİZİK (DR)
Tez Adı : Tetramerik hexcoil-ala demetinin moleküler dinamik simülasyon yöntemi ile incelenmesi
Yüksek Lisans
2010-2012BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİ
FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / FİZİK (YL) (TEZLİ)
Tez Adı : Nadir toprak elementlerinin skyrme-hartree-fock metodu kullanılarak bazı nükleer taban durum özelliklerinin incelenmesi
Lisans
2004-2008GAZİ ÜNİVERSİTESİ
KASTAMONU FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ / FİZİK PR.
Synthesis, Characterization, Antimicrobial Activity and in Silico Studies of Some Phenyl, Furyl and 1H-1,2,4-Triazole Substituted Benzyl and Alkyl Ethers
ChemistrySelect
Tarih: 9/2022 Sayı: 35 Cilt: 7 ÖZEL GÜVEN ÖZDEN, TAHTACI HAKAN, ALTANLAR NURTEN, ALICI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:2365-6549 doi:10.1002/slct.202202046
Synthesis, Characterization, Theoretical Analyses, and Investigation of Their Biological Activities of Acetovanillone-Derived Novel Benzyl Ethers
Polycyclic Aromatic Compounds
Tarih: 9/2022 Sayı: 8 Cilt: 42 Sayfa: 5671-5695 ÇALKILIÇ NAZİRE MERVE, ALICI HAKAN, DİREKEL ŞAHİN, TAHTACI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:1040-6638 doi:10.1080/10406638.2021.1950782
Design and various in silico studies of the novel curcumin derivatives as potential candidates against COVID-19 -associated main enzymes
Computational Biology and Chemistry
Tarih: 6/2022 ALICI HAKAN, DEMİR KADİR, TAHTACI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:1476-9271 doi:10.1016/j.compbiolchem.2022.107657
Structures of the Wild-Type and S59L Mutant CHCHD10 Proteins Important in Amyotrophic Lateral Sclerosis Frontotemporal Dementia
ACS Chemical Neuroscience
Tarih: 4/2022 Sayı: 8 Cilt: 13 Sayfa: 1273-1280 ALICI HAKAN, N. Uversky Vladimir, Kang David E., Woo Junga Alexa, COŞKUNER WEBER ORKİDE
Endeks:SCI ISSN:1948-7193 doi:10.1021/acschemneuro.2c00011
Synthesis, in vitro cytotoxicity, molecular docking and ADME study of some indolin-2-one linked 1,2,3-triazole derivatives
Computational Biology and Chemistry
Tarih: 4/2022 Cilt: 97 Sayfa: 107641-None Das Arnika, Greco Giulia, Kumar Sujeet, Catanzaro Elena, Morigi Rita, Locatelli Alessandra, Schols Dominique, ALICI HAKAN, TAHTACI HAKAN, Ravindran Febina, Fimognari Carmela, S. Karki Subhas
Endeks:SCI-Expanded ISSN:1476-9271 doi:10.1016/j.compbiolchem.2022.107641
Investigation of Inhibition Effect of Nicotine and Dopamine on Alpha-synuclein
Journal of Computational Biophysics and Chemistry
Tarih: 8/2021 Sayı: 05 Cilt: 20 Sayfa: 477-494 ALICI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:2737-4165 doi:10.1142/S2737416521500265
Synthesis, structural characterization, biological activity, and theoretical studies of some novel bridged 2,6 disubstituted imidazothiadiazole analogues
Journal of Heterocyclic Chemistry
Tarih: 6/2021 Cilt: 58 Sayfa: 1321-1343 TUNEL HASAN, ER MUSTAFA, ALICI HAKAN, ONARAN ABDURRAHMAN, KARAKURT TUNCAY, TAHTACI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:0022-152X doi:10.1002/jhet.4260
HnRNPA2 in LC(286-291) Domain Fibrili ve Onun D290V Mutasyonu Hakkında Teorik Bir Çalışma
Journal of the Institute of Science and Technology
Tarih: 6/2021 Sayı: 2 Cilt: 11 Sayfa: 1080-1089 ALICI HAKAN
Endeks:TR DİZİN ISSN:2146-0574 doi:10.21597/jist.845090
Parkinson Hastalığı ile İlişkilendirilen PreNAC Fibril Kesiti ve Onun A53C, A53E, A53G, A53T, A53V Mutasyonlarının Yapısal Kararlılığın Araştırılması
Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi
Tarih: 5/2021 Sayı: 1 Cilt: 16 Sayfa: 66-76 ALICI HAKAN, DEMİR KADİR
Endeks:TR DİZİN ISSN:1306-7575 doi:10.29233/sdufeffd.824140
Investigation of the stability and the helix-tail interaction of sCT and its various charged mutants based on comparative molecular dynamics simulations
Chemical Physics
Tarih: 2/2021 Cilt: 542 Sayfa: 111057-None ALICI HAKAN, DEMİR KADİR
Endeks:SCI-Expanded ISSN:0301-0104 doi:10.1016/j.chemphys.2020.111057
Alpha-synuclein in PreNAC(46-56) Fibril Bölütünün Moleküler Dinamik Simülasyon Yöntemi ile Konformasyonel Değerlendirmesi
Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi
Tarih: 1/2021 Sayı: 1 Cilt: 24 Sayfa: 11-21 ALICI HAKAN
Endeks:TR DİZİN ISSN:2619-9149 doi:10.18016/ksutarimdoga.vi.737200
Synthesis, in silico ADME, molecular docking and in vitro cytotoxicity evaluation of stilbene linked 1,2,3-triazoles
Heliyon
Tarih: 1/2021 Sayı: 1 Cilt: 7 Das Arnika, Kumar Sujeet, Persoons Leentje, Daelemans Dirk, Schols Dominique, ALICI HAKAN, TAHTACI HAKAN, S. Karki Subhas
Endeks:SCI-Expanded ISSN:2405-8440 doi:10.1016/j.heliyon.2020.e05893
Synthesis, Characterization, Antimicrobial Evaluation, and Computational Investigation of Substituted Imidazo[2,1- b][1,3,4]Thiadiazole Derivatives
ChemistrySelect
Tarih: 10/2020 Cilt: 5 Sayfa: 11753-11763 DAĞLI MELTEM, ER MUSTAFA, KARAKURT TUNCAY, ONARAN ABDURRAHMAN, ALICI HAKAN, TAHTACI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:2365-6549","2365-6549 doi:10.1002/slct.202002821
In silico analysis: structural insights about inter-protofilaments interactions for α-synuclein (50-57) fibrils and its familial mutation
Molecular Simulation
Tarih: 8/2020 Sayı: 12 Cilt: 46 Sayfa: 867-878 ALICI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:0892-7022","1029-0435 doi:10.1080/08927022.2020.1786084
Structural analyses and force fields comparison for NACore (68-78) and SubNACore (69-77) fibril segments of Parkinson's disease
Journal of Molecular Modeling
Tarih: 6/2020 Sayı: 6 Cilt: 26 Sayfa: 132-None ALICI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:1610-2940","0948-5023 doi:10.1007/s00894-020-04379-4
Experimental and theoretical studies of electrochemical oxidation of nicotinamide adenine dinucleotide at the modified SWCNT and graphene oxide
Journal of Molecular Modeling
Tarih: 3/2020 Sayı: 3 Cilt: 26 Sayfa: 51-None KOÇAK İZZET, ALICI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:1610-2940","0948-5023 doi:10.1007/s00894-020-4314-y
İnsan Kemokin Reseptörü CXCR3'ün N-Terminal Bölgesinin (1-53) Moleküler Dinamik Simülasyon Yöntemi İle Modellenmesi ve Yapısal Analizi
Karaelmas Science and Engineering Journal
Tarih: 12/2018 Sayı: 2 Cilt: 8 Sayfa: 606-614 ALICI HAKAN,KARACAOĞLAN VOLKAN,DEMİR KADİR
Endeks:TR DİZİN ISSN:2146-7277","2146-4987
Conformational stability of the tetrameric de novo designed hexcoil-Ala helical bundle
Chinese Journal of Physics
Tarih: 2/2018 Sayı: 1 Cilt: 56 Sayfa: 46-57 DEMİR KADİR,ALICI HAKAN,YAŞAR FATİH
Endeks:SCI-Expanded ISSN:05779073 doi:10.1016/j.cjph.2017.12.004
On the nuclear properties of 32S, 64Zn, 67Zn, 89Y, 90Zr and 153Eu targets used for production of 32P, 64Cu, 67Cu, 89Sr, 90Y and 153Sm therapeutic radionuclides
Annals of Nuclear Energy
Tarih: 8/2012 Sayı: 0 Cilt: 46 Sayfa: 128-133 AYTEKİN HÜSEYİN,BALDIK RIDVAN,ALICI HAKAN
Endeks:SCI-Expanded ISSN:0306-4549 doi:10.1016/j.anucene.2012.03.025
INVESTIGATION OF CONFORMATIONAL TRANSITION PROPERTIES OF THE AMYLOID BETA AT NEUTRAL PH AND LOWER PH BY USING MOLECULAR DYNAMIC SIMULATION METHOD
(Özet bildiri)
EURO ASIA 9th. INTERNATIONAL CONGRESS ON APPLIED SCIENCES 11.08.2021 12.08.2021 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:87-88 ISBN:978-625-7720-55-7 Basım Tarihi : 25.08.2021
COMPUTATIONAL STUDIES SUGGEST VARIOUS INHIBITORS OF PAPAIN- LIKE PROTEASE OF MERS-COV FROM CURCUMA LONGA
(Özet bildiri)
EUROASIA Congress on Scientific Researches and Recent Trends-VIII 02.08.2021 04.08.2021 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:99-None ISBN:978-195509415-3 Basım Tarihi : 13.08.2021
Theoretical Elucidations about Aggregation Properties of Aβ40 and Aβ42
(Özet bildiri)
USBIK 2021 INTERNATIONAL CONGRESS ON NATURAL SCINENCESS 26.02.2021 28.02.2021 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:36-None ISBN:978-625- 409-409-5 Basım Tarihi : 20.03.2021
Molecular insights about α-synuclein (50-57) fibril and its familial mutations
(Özet bildiri)
Turkish Physical Society 35th International Physics Congress (TPS-35) 04.09.2019 08.09.2019 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:167-None ISBN:978-605-83516-5-3 Basım Tarihi : 01.09.2019
A MD study regarding conformational properties and structure-activity relationship of sCT and its variouscharged mutants
(Özet bildiri)
2nd International Eurasian Conference onBiological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2019) 28.06.2019 29.06.2019 Sözlü Sunum ALICI HAKAN,DEMİR KADİR Sayfa:396-None Basım Tarihi : 30.06.2019
Comparison of atomistic molecular mechanics force fields for NACore and SubNACore fibrils of Parkinson’sdisease.
(Özet bildiri)
2nd International Eurasian Conference onBiological and Chemical Sciences(EurasianBioChem 2019) 28.06.2019 29.06.2019 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:395-None Basım Tarihi : 30.06.2019
Computer Aided Prediction of Cxcr3 Binding Site
(Özet bildiri)
2nd International Congress on Advances in Bioscience and Biotechnology (ICABB 2018) 26.06.2018 30.06.2018 Sözlü Sunum KARACAOĞLAN VOLKAN,ALICI HAKAN,CEYHAN DENİZ,DEMİR KADİR Sayfa:19-None ISBN:978-605-67206-3-5 Basım Tarihi : 27.09.2018
Structural Analysis of N-Terminal Region (1-53) Of Human Chemokine Receptor CXCR3 By Computational Studies
(Özet bildiri)
SECOND MEDITERRANEAN NATURAL SCIENCES AND ENGINEERING CONGRESS (MENSEC 2018) 26.06.2018 29.06.2019 Sözlü Sunum ALICI HAKAN,KARACAOĞLAN VOLKAN,DEMİR KADİR Sayı: 1 Cilt: 2 Sayfa:25-None Basım Tarihi : 21.06.2018
Investigation Of The Conformational Stability Of Designed Homo Tetrameric Structure
(Özet bildiri)
From Computational Biophysics To System Biology (CBSB2016) , Ankara/TURKEY 23.05.2016 25.05.2016 Poster ALICI HAKAN,DEMİR KADİR,YAŞAR FATİH
The Functionalization of SWCNT andGraphene Oxide for NADH Oxidation: an Experimental and Theoretical Approach
(Özet bildiri)
3RD INTERNATIONAL EURASIAN CONFERENCE ONBIOLOGICAL AND CHEMICAL SCIENCES 19.03.2020 20.03.2020 Sözlü Sunum KOÇAK İZZET,ALICI HAKAN
Nuclear Data Evaluation For Production of 32P 64Cu And 90 Y Therapeutic Radionuclides
(Poster)
Turkish Physics Socieity 28th İnternational Congress 06.09.2011 09.09.2011 hüseyin aytekin, rıdvan baldık, hakan alıcı
Nadir Toprak Elementleri Bölgesinde Bulunan Ce Nd Sm Eu Çekirdeklerinin Bazı Taban Durum Özelliklerinin İncelenmesi
(Özet bildiri)
GEFİK 2012 13.06.2012 15.06.2012 hakan alıcı, rıdvan baldık
ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ
2010BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİ
FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ
FİZİK BÖLÜMÜ / GENEL FİZİK ANABİLİM DALI
Advances in Protein Molecular and Structural Biology Methods
(Bilimsel Kitap)
Bölüm Adı: Chapter 33 - Methods to study the effect of solution variables on the conformational dynamics of intrinsically disordered proteins Editör: Timir Tripathi and Vikash Kumar Dubey Basım Sayısı::(1) Sayfa::551 563 Yayınevi:: Elsevier ( Elsevier Academic Press ) ISBN: 978-0-323-90264-9 Tarih: 2022
BEÜ Bilimsel Araştırma Projesi 2015-22794455-03
Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi 14 (Tamamlandı) 08.04.2015 - 24.11.2017