ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ

İsim:

HAKAN ALICI

e-Posta:

hakanalici

Telefon:

3722912361

Fax:

Yök Akademik Sayfa:

Görüntüle

Çalışma Alanları:

Fizik

Atom, Molekül ve Lazer Fiziği

Biyofizik

Öğrenim Bilgileri

Doktora

2012-2018

BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİ

FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / FİZİK (DR)

Tez Adı : Tetramerik hexcoil-ala demetinin moleküler dinamik simülasyon yöntemi ile incelenmesi

Yüksek Lisans

2010-2012

BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİ

FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ / FİZİK (YL) (TEZLİ)

Tez Adı : Nadir toprak elementlerinin skyrme-hartree-fock metodu kullanılarak bazı nükleer taban durum özelliklerinin incelenmesi

Lisans

2004-2008

GAZİ ÜNİVERSİTESİ

KASTAMONU FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ / FİZİK PR.

Uluslararası Makaleler (19)

Synthesis, Characterization, Antimicrobial Activity and in Silico Studies of Some Phenyl, Furyl and 1H-1,2,4-Triazole Substituted Benzyl and Alkyl Ethers

ChemistrySelect

Tarih: 9/2022 Sayı: 35 Cilt: 7 ÖZEL GÜVEN ÖZDEN, TAHTACI HAKAN, ALTANLAR NURTEN, ALICI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:2365-6549 doi:10.1002/slct.202202046

Website

Synthesis, Characterization, Theoretical Analyses, and Investigation of Their Biological Activities of Acetovanillone-Derived Novel Benzyl Ethers

Polycyclic Aromatic Compounds

Tarih: 9/2022 Sayı: 8 Cilt: 42 Sayfa: 5671-5695 ÇALKILIÇ NAZİRE MERVE, ALICI HAKAN, DİREKEL ŞAHİN, TAHTACI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:1040-6638 doi:10.1080/10406638.2021.1950782

Website

Design and various in silico studies of the novel curcumin derivatives as potential candidates against COVID-19 -associated main enzymes

Computational Biology and Chemistry

Tarih: 6/2022 ALICI HAKAN, DEMİR KADİR, TAHTACI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:1476-9271 doi:10.1016/j.compbiolchem.2022.107657

Website

Structures of the Wild-Type and S59L Mutant CHCHD10 Proteins Important in Amyotrophic Lateral Sclerosis Frontotemporal Dementia

ACS Chemical Neuroscience

Tarih: 4/2022 Sayı: 8 Cilt: 13 Sayfa: 1273-1280 ALICI HAKAN, N. Uversky Vladimir, Kang David E., Woo Junga Alexa, COŞKUNER WEBER ORKİDE

Endeks:SCI ISSN:1948-7193 doi:10.1021/acschemneuro.2c00011

Website

Synthesis, in vitro cytotoxicity, molecular docking and ADME study of some indolin-2-one linked 1,2,3-triazole derivatives

Computational Biology and Chemistry

Tarih: 4/2022 Cilt: 97 Sayfa: 107641-None Das Arnika, Greco Giulia, Kumar Sujeet, Catanzaro Elena, Morigi Rita, Locatelli Alessandra, Schols Dominique, ALICI HAKAN, TAHTACI HAKAN, Ravindran Febina, Fimognari Carmela, S. Karki Subhas

Endeks:SCI-Expanded ISSN:1476-9271 doi:10.1016/j.compbiolchem.2022.107641

Website

Investigation of Inhibition Effect of Nicotine and Dopamine on Alpha-synuclein

Journal of Computational Biophysics and Chemistry

Tarih: 8/2021 Sayı: 05 Cilt: 20 Sayfa: 477-494 ALICI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:2737-4165 doi:10.1142/S2737416521500265

Website

Synthesis, structural characterization, biological activity, and theoretical studies of some novel bridged 2,6 disubstituted imidazothiadiazole analogues

Journal of Heterocyclic Chemistry

Tarih: 6/2021 Cilt: 58 Sayfa: 1321-1343 TUNEL HASAN, ER MUSTAFA, ALICI HAKAN, ONARAN ABDURRAHMAN, KARAKURT TUNCAY, TAHTACI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:0022-152X doi:10.1002/jhet.4260

Website

HnRNPA2 in LC(286-291) Domain Fibrili ve Onun D290V Mutasyonu Hakkında Teorik Bir Çalışma

Journal of the Institute of Science and Technology

Tarih: 6/2021 Sayı: 2 Cilt: 11 Sayfa: 1080-1089 ALICI HAKAN

Endeks:TR DİZİN ISSN:2146-0574 doi:10.21597/jist.845090

Website

Parkinson Hastalığı ile İlişkilendirilen PreNAC Fibril Kesiti ve Onun A53C, A53E, A53G, A53T, A53V Mutasyonlarının Yapısal Kararlılığın Araştırılması

Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Fen Dergisi

Tarih: 5/2021 Sayı: 1 Cilt: 16 Sayfa: 66-76 ALICI HAKAN, DEMİR KADİR

Endeks:TR DİZİN ISSN:1306-7575 doi:10.29233/sdufeffd.824140

Website

Investigation of the stability and the helix-tail interaction of sCT and its various charged mutants based on comparative molecular dynamics simulations

Chemical Physics

Tarih: 2/2021 Cilt: 542 Sayfa: 111057-None ALICI HAKAN, DEMİR KADİR

Endeks:SCI-Expanded ISSN:0301-0104 doi:10.1016/j.chemphys.2020.111057

Website

Alpha-synuclein in PreNAC(46-56) Fibril Bölütünün Moleküler Dinamik Simülasyon Yöntemi ile Konformasyonel Değerlendirmesi

Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tarım ve Doğa Dergisi

Tarih: 1/2021 Sayı: 1 Cilt: 24 Sayfa: 11-21 ALICI HAKAN

Endeks:TR DİZİN ISSN:2619-9149 doi:10.18016/ksutarimdoga.vi.737200

Website

Synthesis, in silico ADME, molecular docking and in vitro cytotoxicity evaluation of stilbene linked 1,2,3-triazoles

Heliyon

Tarih: 1/2021 Sayı: 1 Cilt: 7 Das Arnika, Kumar Sujeet, Persoons Leentje, Daelemans Dirk, Schols Dominique, ALICI HAKAN, TAHTACI HAKAN, S. Karki Subhas

Endeks:SCI-Expanded ISSN:2405-8440 doi:10.1016/j.heliyon.2020.e05893

Website

Synthesis, Characterization, Antimicrobial Evaluation, and Computational Investigation of Substituted Imidazo[2,1- b][1,3,4]Thiadiazole Derivatives

ChemistrySelect

Tarih: 10/2020 Cilt: 5 Sayfa: 11753-11763 DAĞLI MELTEM, ER MUSTAFA, KARAKURT TUNCAY, ONARAN ABDURRAHMAN, ALICI HAKAN, TAHTACI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:2365-6549","2365-6549 doi:10.1002/slct.202002821

Website

In silico analysis: structural insights about inter-protofilaments interactions for α-synuclein (50-57) fibrils and its familial mutation

Molecular Simulation

Tarih: 8/2020 Sayı: 12 Cilt: 46 Sayfa: 867-878 ALICI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:0892-7022","1029-0435 doi:10.1080/08927022.2020.1786084

Website

Structural analyses and force fields comparison for NACore (68-78) and SubNACore (69-77) fibril segments of Parkinson's disease

Journal of Molecular Modeling

Tarih: 6/2020 Sayı: 6 Cilt: 26 Sayfa: 132-None ALICI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:1610-2940","0948-5023 doi:10.1007/s00894-020-04379-4

Website

Experimental and theoretical studies of electrochemical oxidation of nicotinamide adenine dinucleotide at the modified SWCNT and graphene oxide

Journal of Molecular Modeling

Tarih: 3/2020 Sayı: 3 Cilt: 26 Sayfa: 51-None KOÇAK İZZET, ALICI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:1610-2940","0948-5023 doi:10.1007/s00894-020-4314-y

Website

İnsan Kemokin Reseptörü CXCR3'ün N-Terminal Bölgesinin (1-53) Moleküler Dinamik Simülasyon Yöntemi İle Modellenmesi ve Yapısal Analizi

Karaelmas Science and Engineering Journal

Tarih: 12/2018 Sayı: 2 Cilt: 8 Sayfa: 606-614 ALICI HAKAN,KARACAOĞLAN VOLKAN,DEMİR KADİR

Endeks:TR DİZİN ISSN:2146-7277","2146-4987

Website

Conformational stability of the tetrameric de novo designed hexcoil-Ala helical bundle

Chinese Journal of Physics

Tarih: 2/2018 Sayı: 1 Cilt: 56 Sayfa: 46-57 DEMİR KADİR,ALICI HAKAN,YAŞAR FATİH

Endeks:SCI-Expanded ISSN:05779073 doi:10.1016/j.cjph.2017.12.004

Website

On the nuclear properties of 32S, 64Zn, 67Zn, 89Y, 90Zr and 153Eu targets used for production of 32P, 64Cu, 67Cu, 89Sr, 90Y and 153Sm therapeutic radionuclides

Annals of Nuclear Energy

Tarih: 8/2012 Sayı: 0 Cilt: 46 Sayfa: 128-133 AYTEKİN HÜSEYİN,BALDIK RIDVAN,ALICI HAKAN

Endeks:SCI-Expanded ISSN:0306-4549 doi:10.1016/j.anucene.2012.03.025

Website

Uluslararası Bildiriler (11)

INVESTIGATION OF CONFORMATIONAL TRANSITION PROPERTIES OF THE AMYLOID BETA AT NEUTRAL PH AND LOWER PH BY USING MOLECULAR DYNAMIC SIMULATION METHOD

(Özet bildiri)

EURO ASIA 9th. INTERNATIONAL CONGRESS ON APPLIED SCIENCES 11.08.2021 12.08.2021 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:87-88 ISBN:978-625-7720-55-7 Basım Tarihi : 25.08.2021

Website

COMPUTATIONAL STUDIES SUGGEST VARIOUS INHIBITORS OF PAPAIN- LIKE PROTEASE OF MERS-COV FROM CURCUMA LONGA

(Özet bildiri)

EUROASIA Congress on Scientific Researches and Recent Trends-VIII 02.08.2021 04.08.2021 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:99-None ISBN:978-195509415-3 Basım Tarihi : 13.08.2021

Website

Theoretical Elucidations about Aggregation Properties of Aβ40 and Aβ42

(Özet bildiri)

USBIK 2021 INTERNATIONAL CONGRESS ON NATURAL SCINENCESS 26.02.2021 28.02.2021 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:36-None ISBN:978-625- 409-409-5 Basım Tarihi : 20.03.2021

Website

Molecular insights about α-synuclein (50-57) fibril and its familial mutations

(Özet bildiri)

Turkish Physical Society 35th International Physics Congress (TPS-35) 04.09.2019 08.09.2019 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:167-None ISBN:978-605-83516-5-3 Basım Tarihi : 01.09.2019

A MD study regarding conformational properties and structure-activity relationship of sCT and its variouscharged mutants

(Özet bildiri)

2nd International Eurasian Conference onBiological and Chemical Sciences (EurasianBioChem 2019) 28.06.2019 29.06.2019 Sözlü Sunum ALICI HAKAN,DEMİR KADİR Sayfa:396-None Basım Tarihi : 30.06.2019

Comparison of atomistic molecular mechanics force fields for NACore and SubNACore fibrils of Parkinson’sdisease.

(Özet bildiri)

2nd International Eurasian Conference onBiological and Chemical Sciences(EurasianBioChem 2019) 28.06.2019 29.06.2019 Sözlü Sunum ALICI HAKAN Sayfa:395-None Basım Tarihi : 30.06.2019

Website

Computer Aided Prediction of Cxcr3 Binding Site

(Özet bildiri)

2nd International Congress on Advances in Bioscience and Biotechnology (ICABB 2018) 26.06.2018 30.06.2018 Sözlü Sunum KARACAOĞLAN VOLKAN,ALICI HAKAN,CEYHAN DENİZ,DEMİR KADİR Sayfa:19-None ISBN:978-605-67206-3-5 Basım Tarihi : 27.09.2018

Website

Structural Analysis of N-Terminal Region (1-53) Of Human Chemokine Receptor CXCR3 By Computational Studies

(Özet bildiri)

SECOND MEDITERRANEAN NATURAL SCIENCES AND ENGINEERING CONGRESS (MENSEC 2018) 26.06.2018 29.06.2019 Sözlü Sunum ALICI HAKAN,KARACAOĞLAN VOLKAN,DEMİR KADİR Sayı: 1 Cilt: 2 Sayfa:25-None Basım Tarihi : 21.06.2018

Investigation Of The Conformational Stability Of Designed Homo Tetrameric Structure

(Özet bildiri)

From Computational Biophysics To System Biology (CBSB2016) , Ankara/TURKEY 23.05.2016 25.05.2016 Poster ALICI HAKAN,DEMİR KADİR,YAŞAR FATİH

The Functionalization of SWCNT andGraphene Oxide for NADH Oxidation: an Experimental and Theoretical Approach

(Özet bildiri)

3RD INTERNATIONAL EURASIAN CONFERENCE ONBIOLOGICAL AND CHEMICAL SCIENCES 19.03.2020 20.03.2020 Sözlü Sunum KOÇAK İZZET,ALICI HAKAN

Nuclear Data Evaluation For Production of 32P 64Cu And 90 Y Therapeutic Radionuclides

(Poster)

Turkish Physics Socieity 28th İnternational Congress 06.09.2011 09.09.2011 hüseyin aytekin, rıdvan baldık, hakan alıcı

Ulusal Bildiriler (1)

Nadir Toprak Elementleri Bölgesinde Bulunan Ce Nd Sm Eu Çekirdeklerinin Bazı Taban Durum Özelliklerinin İncelenmesi

(Özet bildiri)

GEFİK 2012 13.06.2012 15.06.2012 hakan alıcı, rıdvan baldık

Akademik Görevler

ARAŞTIRMA GÖREVLİSİ

2010

BÜLENT ECEVİT ÜNİVERSİTESİ

FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ

FİZİK BÖLÜMÜ / GENEL FİZİK ANABİLİM DALI

Kitaplar (1)

Advances in Protein Molecular and Structural Biology Methods

(Bilimsel Kitap)

Bölüm Adı: Chapter 33 - Methods to study the effect of solution variables on the conformational dynamics of intrinsically disordered proteins Editör: Timir Tripathi and Vikash Kumar Dubey Basım Sayısı::(1) Sayfa::551 563 Yayınevi:: Elsevier ( Elsevier Academic Press ) ISBN: 978-0-323-90264-9 Tarih: 2022

Projeler (1)

BEÜ Bilimsel Araştırma Projesi 2015-22794455-03

Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi 14 (Tamamlandı) 08.04.2015 - 24.11.2017